Als 13 "Börger" aus Rostock gegen Ende des 17. Jahrhunderts sich am Ortsende von Rethwisch ansiedelten entstand Börgerende. In dieser Zeit und auch in den darauffolgenden Jahrhunderten waren der Fischfang, die Landwirtschaft und die Reetgewinnung die Haupteinnahmequellen der Dorfbewohner. Dies änderte sich erst als um die Jahrhundertwende die ersten Badegäste Börgerende für sich entdeckten und somit auch das Ortsbild allmählich veränderten.   

Mit der Sturmflut im Herbst 1872 brach die Ostsee nahe Börgerende durch und überschwemmte große Teile der Conventer Niederung. Das Wasser reichte damals bis zur Münsterstadt Bad Doberan. Deshalb wurden in den folgenden Jahren die Deiche aufgeschüttet und verstärkt. 

Heute gehört Börgerende der Gemeinde Börgerende-Rethwisch  an  und es leben ca. 1.800 Einwohner hier.